放心吧，它只會刪安裝時生成的文件，系統設置也會恢復原樣，安裝程序自己不會被刪~

想卸載軟件，可就是卸載不干凈，總留下那以幾個文件刪不掉，可能的原因是你的軟件沒有用正當的手法去卸載，一個不小心上當了，誤裝了流氓軟件，想卸還卸不掉，真是煩人。網絡上到關于這方面的軟件不少，可以看看

1、巧用qq來卸載頑固程序：將qq安裝目錄下的unins000.exe文件拷貝到要卸載文件的安裝目錄，再執行該程序即可!這種辦法對于卸載那些反安裝程序丟失或者損壞的文件有特效。

2、winamp的卸載程序可以安全卸載大部分應用程序：首先在“我的電腦”找到winamp安裝目錄下的uninstwp.exe程序，復制并粘貼到頑固程序所在的文件夾中，雙擊運行該程序就可以把頑固程序卸載得干干凈凈了。

3、運用winrar卸載頑固程序：通過其地址欄定位到頑固程序所在文件夾，再點工具欄上的“添加”按紐，此時會彈出“檔案文件名字和參數”對話框，在“存檔選項”中勾選“存檔后刪除原文件”點擊“確定”，等壓縮完成后，winrar會自動刪除頑固軟件文件夾，然后手工將剛生成的壓縮包刪除，一切搞定。

4、微軟反間諜軟件完美卸載3721程序：首先下載微軟反間諜軟件microsoftantispywareinstall.exe，界面是英文的，文字相當于高中英語水平，慢慢看能懂，安裝后按提示升級最新數據庫，執行scan，后發現100多個3721，cns*的東西，選擇remove，慢慢的微軟反間諜軟件清除3721，cns*的東西，再提示重新啟動機器;第一次3721還沒清除完，在/programfiles/下還有3721目錄，先卸載網絡實名，右鍵清除開始--程序菜單中的3721條，再運行微軟反間諜軟件，掃描后發現多個3721，cns*的東西，但數量比第一次少多了選擇，選擇remove，清除3721，cns*的東西，再重新啟動機器,這樣就徹底清除3721。

5、運用windowsxp附帶的msicuu.exe、msizap.exe來徹底卸載頑固程序：首先要打開windowsxp安裝盤，點“supporttools”，進入硬盤的supporttools安裝目錄(x:programfilessupporttools)，找到msicuu.exe并雙擊，于是就會彈出一個“windowsinstallercleanup”窗口，顯示當前已安裝的所有程序列表。你從中選擇頑固程序，然后單擊“rmove”按鈕即可卸載。如果以上方法無效，建議你用msizap.exe來卸載，方法是：打開注冊表編輯器，定位到hkey_local_machinesoftwaremicrosoftwindowscurrentversionuninstall，在左邊項中找到頑固程序的標識，然后依次選擇“開始→程序→windowssupporttools→commandprompt”命令，命令提示符后，輸入以下命令：msizapt，按回車后即可卸載頑固程序。

6、超級兔子優化王中提供了一個專業卸載功能，可以讓你輕松卸載一些常見的頑固軟件及ie插件。首先選擇優化王下的“卸載軟件”功能，然后切換到“專業卸載”選項卡，此處提供了18種軟件的卸載功能。超級兔子優化王軟件會自動對系統進行檢測，若裝有該程序的話此處便會顯示“已安裝”，接著選中要卸載的軟件，單擊“下一步”就可以把這些程序清理干凈，將它們徹底趕出系統。

如何將軟件殘留垃圾全清除

在“開始→運行”窗口中輸入msconfig.exe，確定后出現“系統配置實用程序”。點菜單欄里的“啟動”按鈕，就會看到軟件被清除后殘留的垃圾（如果有垃圾）。

對于大多數啟動項來說，在用360安全衛士的啟動項管理，就可以把它們清除掉。但并不徹底。尤其對那些顯示位置是startup和commonstartup的啟動項。就讓我們把它們揪出來！！！

在“開始→運行”窗口中輸入regedit.exe打開注冊表編輯器，然后依次展開hkey_local_machinesoftwaremicrosoftsharedtoolsmsconfigstartupreg，你會看到其下有許多項，選中它，在右邊窗格中你會看到key鍵值指向的是注冊表中啟動的位置，mommon鍵值是程序文件所在路徑。右擊殘留的選項，選刪除，會彈出警告，不用理會，確定后消滅它！

除此之外，還有一處，展開hkey_current_usersoftwaremicrosoftsharedtoolsmsconfigstartupreg，按照上面的步驟刪除那些無用項。

再打開系統配置實用程序，看看啟動標簽下是不是干干凈凈

卸載的時候看清楚文字提示，一步一步慢慢來，一般涉及到要刪除什么的時候都會出面要打勾去勾的選項，看清楚操作就行。
下載軟件卸載一般都不會有刪除下載文件的選項。
希望對你有幫助。